场流分离仪由载液储瓶、输液泵、进样阀、柱槽、检测器、控制和数据处理系统组成。载液或流动相为水、缓冲液和二有机溶剂,如甲醇、乙醇、乙腈、四氢呋喃、苯、甲苯、二甲亚砜等。输液泵的操作压力一般低于20×105Pa,流速控制在0.1-30mL·min-1。由于工作压力较低,液相色谱各种进样装置均可使用。检测器、计算机控制系统亦与HPLC相似。
场流分离仪柱槽是分离技术核心,通常柱槽是在两块平行板之间放置薄的塑料或金属片组成一个两头呈三角形的矩形带状管道。外场作用力自上而下垂直作用于管道。管道上板为排斥壁,下板为富集壁。平行板的材料为金属、玻璃、多孔陶瓷、塑料等。柱槽长30-90cm,宽1-2cm,厚50-500μm。如离心力场分离仪将90cm柱槽弯曲成半径16.5cm的圆形嵌入离心机转子上,柱槽随转子转动产生垂直于柱槽的离心力。离心场转速500-2500r/min,柱槽厚度100-250um,泵驱动载液流速0.5-10mL·min-1。